jen suis maintenant à installer ces deux Argo Fet pour permettre à l’alternateur de charger les batteries en fonction de leur capacité... si j’ai bien compris le mode d’emploi...

L’argofet permet à l’alternateur de charger simultanément la batterie moteur et la batterie servitude. L’alternateur produira un courant (en fait, plus ou moins de courant) sous une tension qui dépendra de la tension apperçue sur D+ (61, c’est l’excitation) lequel doit être raccordé au energize du argofet (voir schéma).
La documentation ne précise pas du tout le comportement de cette tension d’excitation energize et comment elle est fabriquée en fonction de la tension sur output1 et output2, et c’est là que le bât blesse comme il a toujours blessé avec les répartiteurs historique (ceux à diodes chutant 0,6V).
Il faudrait, lorsqu’une batterie est bien vide (la batterie de servitude, le plus souvent) ou bien sollicitée (sa tension est alors faible) que l’excitation (fabriquée sur energize) reflète cette faible tension histoire de pousser l’alternateur à produire beaucoup, la tension de l’aternateur montant progressivement jusqu’à atteindre une valeur élevée (autour de 14V pour du plomb) à mesure que la batterie la plus déchargée se remplie.
Il faut donc que le répartiteur soit assez astucieux (intelligent dira le marketting) pour fabriquer un energize qui remplisse au mieux et au plus vite la batterie la plus déchargée. Le plus souvent le energize sur des répartiteurs historiques était pris sur la batterie servitude éventuellement compensée de la chute des 0,6V. On relira avec intérêt ce que Pallas (au édition AETA) en écrit.
En fait il faudrait que le argofet se comporte comme un vrai régulateur.

Cette difficulté à atteindre cet objectif a conduit (dans mon esprit) progressivement à abandonner les répartiteurs pour des booster à deux sorties

Pour conclure votre assertion : oui et non, le argofet chargera les batteries en fonction de leur capacité (vrai si les deux parcs sont de même techno et au même %age de charge) , et non, le argofet ne rechargera pas une batterie en fonction de son état de décharge. Le but recherché sra rarement atteint.