je précise, mesure prise 5 minutes après déconnexion.

Ce n’est pas suffisant, il faut de l’ordre de 2 heures de repos intégral après une décharge et deux à quatre-vingt sieze haure après une recharge (mais on retient deux). Et repos intégral c’est vraiement intégral, idéalement la batterie est en circuit ouvert, déconnectée de tout

Par contre, une fois au repos la tension est très représentative de la charge et entre chaque batterie on ne doit pas trouver plus de 0,1 Volt d’écart sinon c’est que les batteries ne sont pas également chargées, certaines se déchargent alors dans les autres, ce qui n’est pas bon du tout.
C’est le moment de compléter le niveau d’électrolyte et d’égaliser (pour un parc en état raisonnable c’est - après recharge à bloc - 4 heures à 15,5V - 16V sans dépasser 40 °C sur le bac de la batterie et avec toujours de l’électrolyte au dessus des plaques) histoire de recharger (et au delà) énergiquement tout ce petit monde, et donc de trouver tout le monde à 100%. Bien sur c’est une surcharge qui endommage un peu les batteries mais bien moins que les conserver inégalement chargées

Ce qui est vrai entre batteries l’est aussi pour les éléments (6 pour une 12V) de chaque batterie chargée à bloc : la densité (équivalente à la tension, à mesurer au repos) ne doit pas varier de plus de 0,01 (ex : 1,28 sur un élément, 1,27 sur un autre) d’un élément à l’autre. Dans le cas contraire, égaliser.

j’avais 12.1V sur la « mauvaise » et 13.1 à 13.5 sur les autres

A l’évidence elles ne sont pas reposées, 13,1 à 13,5 c’est trop élevé. Après 2 à 96 heures ça devrait tomber autour de 12,8V (dépend de la température, de la techno et de la santé de la batterie, du fabricant, etc.)
Mais il y a fort à parier qu’après repos la 12,1V restera très basse, indication qu’elle ne se recharge plus. A notre niveau on dit qu’elle est morte ou en tout cas extrêmement sulfatée et non désulfatable avec nos moyens.